L’AMAP de Chantilly est administrée par un conseil collégial, qui gère les problématiques du quotidien et se réunit régulièrement pour prendre des décisions sur le fonctionnement de l’AMAP. Le conseil collégial s’appuie aussi sur l’aide de plusieurs membres actifs qui sont chacun référent pour un producteur ou un aspect de la vie de l’AMAP.
Une Assemblée Générale est organisée tous les ans (généralement à l’automne) afin de présenter le bilan de l’année aux Amapiens et de prendre ensemble les décisions futures. Tous les Amapiens y sont conviés.